История учебного заведения начинается с 1953 года. Прошло более 60 лет со дня основания Кыргызского экономического университета им. М.Рыскулбекова. За это время университет превратился в крупный образовательный центр, который сегодня справедливо гордится своими славными традициями и историей. Кыргызский экономический университет – это единственный государственный университет экономического профиля, соответствующий мировым стандартам качества. Университет с развитой материально-технической базой, телекоммуникационной инфраструктурой, учебно-методическими и научно-исследовательскими комплексами. Университет уделяет значительное внимание развитию фундаментальных и прикладных исследований. С 2004 года в университете ведется обучение по принципам Болонского процесса.
НИУ КЭУ осуществляет подготовку по следующим направлениям: экономика, менеджмент, туризм, коммерция, управление бизнесом, бизнес-информатика, информационные системы и технологии, информационная безопасность, бизнес права, социальная работа.
Миссия университета – подготовка высококвалифицированных и высокообразованных специалистов с международно-признанными дипломами и востребованными во всех секторах экономики, специалистов, способных к практической реализации полученных знаний в экономике, производстве и предпринимательской деятельности.